Tahun ajaran di Kyoto Reigaku International Academy dibagi menjadi tiga semester, yaitu musim semi, musim panas, dan musim gugur. Kelas bahasa Jepang dari tingkat pemula hingga tingkat atas diatur berdasarkan level setiap semester, sehingga siswa selalu dapat belajar di kelas yang sesuai dengan kemampuan mereka. Selain itu, untuk memenuhi berbagai kebutuhan peserta didik, kelas dibagi menjadi beberapa kategori berdasarkan tujuan, seperti “Kelas persiapan Ujian Masuk Universitas Jepang untuk Siswa Internasional (EJU)”, “Kelas persiapan sekolah pascasarjana”, dan “Kelas persiapan N1”. Ditambah lagi, ada juga berbagai pengalaman belajar langsung seperti kontes pidato di sekolah, jamuan makan gyoza, dan kunjungan lapangan dua kali setahun.